Еще в 16 лет он окончил с золотой медалью местную физико-математическую школу и поступил на физический факультет МГУ имени Ломоносова. В возрасте 22 лет он начал свою трудовую деятельность в финансовой корпорации "САПИ", а в 23 года был назначен зампредом правления "Алмазэргиэнбанка".
В 25 лет Николаев был избран депутатом Ил Тумэна по Оленекскому одномандатному округу, став самым молодым народным депутатом в истории парламента Якутии. В последующие годы он занимал ряд высоких должностей, включая руководителя АГиП, министра финансов Якутии, первого зампреда правительства и мэра Якутска. На пост главы Якутии он пришел в возрасте 46 лет.
Айсен Николаев активно работает на благо региона и заботится о его развитии.